拟订行业财务会计、资产和专项资金管理制度，指导行业财会改革工作；负责公路、水路基础设施建设融资、信贷、外汇、利用外资等财务管理工作；组织拟订公路、水路投融资政策，协调有关财税政策；监督交通规费资金的使用；负责公路收费权转让、质押管理工作；承担预决算、政府采购及资产管理工作；负责局机关财务工作；负责内部审计工作，建立健全内部审计制度。